NATURE & PROGRES gère une marque associative privée (ou mention). Comme un label, elle est conditionnée au respect d’un certain nombre d’exigences détaillées dans ses cahiers des charges et sa charte. La mention Nature & Progrès n’apporte pas une certification " Agriculture Biologique ".
L’attribution de la mention s’effectue dans le cadre des Systèmes Participatifs de Garantie (SPG) qui rassemblent les adhérents consommateurs et professionnels.

Dans l'Aude, la mention est gérée par une Commission Mixte d'Agrément et de Contrôle composée de membres élus lors de l'Assemblée Générale du groupe. Les enquêtes sont menées par des binômes composés d'un producteur et d'un consommateur.